### R code from vignette source 'ExtendingGenomicRanges.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: style ################################################### BiocStyle::latex(use.unsrturl=FALSE) ################################################### ### code chunk number 2: options ################################################### options(width=72) options(showHeadLines=3) options(showTailLines=3) ################################################### ### code chunk number 3: granges-ranges ################################################### library(GenomicRanges) selectMethod(ranges, "GRanges") ################################################### ### code chunk number 4: delegating-granges-ranges ################################################### selectMethod(ranges, "DelegatingGenomicRanges") ################################################### ### code chunk number 5: gnclist-granges ################################################### getSlots("GNCList")["granges"] ################################################### ### code chunk number 6: vranges ################################################### GenomicRanges:::extraColumnSlotNames(VariantAnnotation:::VRanges())