### R code from vignette source 'CreatingPharmacoSet.Rnw' ### Encoding: UTF-8 ################################################### ### code chunk number 1: setup (eval = FALSE) ################################################### ## options(keep.source=TRUE) ################################################### ### code chunk number 2: CreatingPharmacoSet.Rnw:128-129 (eval = FALSE) ################################################### ## Biobase::annotation(eset) <- "rna" ################################################### ### code chunk number 3: CreatingPharmacoSet.Rnw:189-201 (eval = FALSE) ################################################### ## PharmacoSet(name, ## molecularProfiles=list(), ## cell=data.frame(), ## drug=data.frame(), ## sensitivityInfo=data.frame(), ## sensitivityRaw=array(dim=c(0,0,0)), ## sensitivityProfiles=matrix(), ## curationDrug=data.frame(), ## curationCell=data.frame(), ## curationTissue=data.frame(), ## datasetType=c("sensitivity", "perturbation", "both"), ## verify = TRUE)