### R code from vignette source 'triform.Rnw' ### Encoding: UTF-8 ################################################### ### code chunk number 1: Loading triform ################################################### library(triform) ################################################### ### code chunk number 2: Preprocessing BED files using configuration file ################################################### config.file.path = system.file("extdata", "config.yml", package="triform") data.file.path = system.file("extdata", package="triform") preprocess(config.file.path, params=list(READ.PATH=data.file.path, COVER.PATH=data.file.path)) ################################################### ### code chunk number 3: