### R code from vignette source 'pvac.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: install (eval = FALSE) ################################################### ## source("http://bioconductor.org/biocLite.R") ## biocLite("pvac") ################################################### ### code chunk number 2: steps (eval = FALSE) ################################################### ## library(affy) ## abatch <- ReadAffy(celfile.path="/my/directory/celfiles") ################################################### ### code chunk number 3: steps (eval = FALSE) ################################################### ## myeset <- rma(abatch) ################################################### ### code chunk number 4: steps (eval = FALSE) ################################################### ## library(pvac) ## ft <- pvacFilter(abatch) ## myeset <- eset[ft$aset,] ################################################### ### code chunk number 5: