### R code from vignette source 'gCMAPWeb.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: gCMAPWeb.Rnw:175-183 ################################################### library(gCMAPWeb) data( "cmap1" ) cmap1 experimentData( cmap1 )@title abstract( cmap1 ) data( "cmap5" ) cmap5 ################################################### ### code chunk number 2: gCMAPWeb.Rnw:190-191 ################################################### cmap1@experimentData@other$supported.query <- c("unsigned", "directional") ################################################### ### code chunk number 3: gCMAPWeb.Rnw:198-202 ################################################### head( pData( cmap1 ), n=3) varMetadata( cmap1 ) varMetadata( cmap1 )$include <- c(TRUE, TRUE, FALSE) varMetadata( cmap1 ) ################################################### ### code chunk number 4: gCMAPWeb.Rnw:476-477 ################################################### sessionInfo()