### R code from vignette source 'vignettes/annotate/inst/doc/chromLoc.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: buildCL ################################################### library("annotate") z <- buildChromLocation("hgu95av2") z ################################################### ### code chunk number 2: showBasicMethods ################################################### organism(z) dataSource(z) ## The chromLocs list is extremely large. Let's only ## look at one of the elements. names(chromLocs(z)) chromLocs(z)[["Y"]] get("32972_at", probesToChrom(z)) chromInfo(z) get("32972_at", geneSymbols(z)) ################################################### ### code chunk number 3: nChrom ################################################### nChrom(z)